Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms