Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms