Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NESP48681 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NESP48681 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms