Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP8P40818 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP8P40818 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms