Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms