Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC8A1P32418 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC8A1P32418 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC8A1P32418 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms