Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XBP1P17861 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XBP1P17861 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms