Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DMDP11532 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DMDP11532 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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