Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI3P10071 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI3P10071 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms