Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms