Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms