Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms