Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms