Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms