Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms