Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms