Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2A3Q93084 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2A3Q93084 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms