Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms