Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms