Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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