Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms