Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms