Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms