Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TGM4P49221 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGM4P49221 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms