Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms