Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXP28300 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXP28300 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXP28300 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXP28300 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXP28300 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXP28300 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXP28300 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms