Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GLI4P10075 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GLI4P10075 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms