Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms