Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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