Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms