Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CNTN3Q9P232 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CNTN3Q9P232 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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