Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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RAB9BQ9NP90 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB9BQ9NP90 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RAB9BQ9NP90 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RAB9BQ9NP90 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RAB9BQ9NP90 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RAB9BQ9NP90 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RAB9BQ9NP90 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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