Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMBRA1Q9C0C7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMBRA1Q9C0C7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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