Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM47Q96LD4 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms