Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGBD4Q96DM1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms