Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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