Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AKR1B1P4-201ENST00000426552 922 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms