Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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