Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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