Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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