Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms