Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms