Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVFRD-1P60508 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms