Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms