Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms