Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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