Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NESP48681 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NESP48681 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NESP48681 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms