Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms