Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms