Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP2P32456 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP2P32456 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms